Hari kedua pelaksanaan Ujian Tertulis Berbasis Komputer (UTBK) Seleksi Bersama Masuk Perguruan Tinggi Negeri (SBMPTN) di Universitas Musamus berlangsung pada hari Senin, 06 Juli 2020 jam 14.15 WIT sampai dengan jam 16.15 WIT. Sebagaimana pada hari pertama, pelaksanaan di hari kedua ini panitia telah menyiapkan protokol pelaksanaan dalam kondisi pandemi Covid-19. Protokol tersebut meliputi protokol sebelum pelaksanaan ujian, pada pelaksanaan ujian serta pasca pelaksanaan ujian.
Sebelum pelaksanaan ujian, seluruh peserta diharuskan mencuci tangan dengan sabun yang telah disediakan di depan pintu ruangan ujian, pembersihan tangan dengan sanitizer, pemeriksaan suhu tubuh dengan infrared, dan wajib menggunakan masker. Setiap peserta diberikan sarung tangan sebelum memasuki ruang ujian.
Kegiatan ujian dihari kedua ini diikuti oleh 141 peserta untuk bidang saintek maupun soshum. Selama pelaksanaan ujian baik pada hari pertama maupun hari kedua, tidak terjadi hal-hal yang mengganggu proses ujian sehingga seluruh peserta dapat mengikuti ujian dengan baik.
